C. margaritiferus trưởng thành đạt kích thước khoảng 11 cm. Đầu có một dải màu nhạt nằm dưới mắt kéo dãi đến xung quanh chóp mõm. Hai bên thân có 2 sọc ngang màu trắng hoặc là những hàng chấm tạo thành. Một dải màu trắng khác xuất hiện ở giữa cuống đuôi (có lẽ là phần kéo dài của sọc phía trước). Một dải khác nằm ở mặt trên cuống đuôi[2].

Số gai ở vây lưng: 12; Số tia vây mềm ở vây lưng: 8; Số gai ở vây hậu môn: 3; Số tia vây mềm ở vây hậu môn: 9; Số gai ở vây bụng: 1; Số tia vây mềm ở vây bụng: 5[3].

Thức ăn của C. margaritiferus là những loài động vật không xương sống có vỏ cứng như những thành viên khác trong cùng chi. Không rõ chúng có được đánh bắt nhằm mục đích gì hay không[1][2].